膠回收試劑盒操作步驟(omega)
1. 配制瓊脂糖EB凝膠,電泳以分離DNA片段。任何類型或等級的瓊脂糖都可以使用。
我們強烈的推薦使用新鮮的TAE/TBE電泳緩沖液。不要重復使用電泳緩沖液,舊的電泳緩沖液PH會增加而降低DNA的回收產(chǎn)量;
2. 電泳足夠時間后,在紫外燈下小心地把所需的DNA的片段切下來。并盡量去除多余的凝膠。
注意:DNA在紫外燈下的曝光的時間不要超過30秒,同時在紫外燈下操作的時候一定要戴保護眼鏡。
3. 稱取空離心管的重量,切下帶目的片段的凝膠裝在1.5ml離心管中并稱其重量,求出凝膠塊的重量,近似地確定其體積。一般情況下,凝膠的密度為1g/ml,于是凝膠的體積與重量的關系可按下面換算:凝膠薄片的重量為0.2g 則其體積為0.2ml;加入等倍凝膠體積的Binding Buffer,把混合物置于55℃~65℃水浴中溫浴7min凝膠*融化,其間每隔2-3分鐘混勻一次;
重要提醒:在凝膠*溶解之后,注意凝膠-Binding Buffer混合物的pH值。如果其pH值大于8的話,DNA的產(chǎn)量將大大減少。觀察混合物的顏色,如果是橙色或紅色,則要加入5μl 濃度為5 M,pH為5.2的醋酸鈉,以調(diào)低其pH值。經(jīng)過這一調(diào)節(jié),該混合物的顏色將恢復為正常的淺黃色。一般情況下,使用新鮮的電泳緩沖液,凝膠-Binding buffer混合物的PH值的不會升高;
4. 轉移700μl的DNA-瓊脂糖溶液到一個HiBindTM DNA柱子,并把柱子裝在一個干凈的2ml收集管內(nèi),室溫下,10,000×g離心1min,棄去液體。
一個HiBind DNA柱子多可容納700μl的溶液,如果DNA-瓊脂糖混合物的體積大于700μl,可先轉移700μl溶液柱子,離心完后,將余下的溶液繼續(xù)加上柱子上。但是每一個HiBindTM柱子多可以結合25~30μg DNA。如果預期產(chǎn)量較大,則把樣品分別加到合適數(shù)目的柱中。
5. 將柱子重新套回收集管中,加300μl Binding BufferHiBind DNA 柱子中;室溫下,10,000×g離心 1分鐘,去棄濾出液;這一步相當關鍵,不要忽略此步。
6. 將柱子重新套回收集管中,加入700μl SPW Wash bufferHiBind DNA柱子中,室溫下,10,000×g離心1分鐘,去棄濾出液;注:SPW Wash buffer在使用前必須按瓶子標鑒要求用無水乙醇進行稀釋。
7. 將柱子重新套回收集管中,重復加入700μl SPW Wash bufferHiBind DNA柱子中,室溫下,10,000×g離心1分鐘,去棄濾出液;
8. 棄去液體,將空柱子重新套回收集管中,10,000×g離心1min以甩干柱基質(zhì)殘余的液體。
這步可以去除柱子基質(zhì)上殘余的乙醇,不要省略此步―――對得到好的DNA產(chǎn)量是十分重要的。
9. 把柱子裝在一個干凈的1.5ml離心管上,加入30~50μl洗脫液或滅菌水上柱子膜上,10,000×g離心1分鐘,離心管中的溶液就是純化的DNA產(chǎn)物,保存于-20度。
如果再洗脫一次的話可以把殘余的DNA洗脫出來,不過那樣的濃度就會較低。
DNA的產(chǎn)量及質(zhì)量:
把純化產(chǎn)物的樣品稀釋一定的倍數(shù)后,分別在260nm和280nm下測其光吸收值,回收得到的DNA的濃度可按以下公式來計算: DNA濃度=光吸收260×50×稀釋倍數(shù)μg/ml
長度大于500bp的片段通常能純化得到80%的產(chǎn)量。 而50bp~500bp的帶則可達到55%~80%的回收率。(光吸收260/光吸收280)的比率是核酸純度的一個標記。如果此值1.8,則意味著核酸的純度>90%。另一方面,如果純化產(chǎn)物的產(chǎn)量較低時,可以用瓊脂糖EB電泳估算產(chǎn)物的濃度。